Mykonos verdankt seinen Namen dem Sohn des Königs von Delos. Tatsächlich war in der Antike die Geschichte von Mykonos mit der von Delos verbunden. Jedoch ist in Wirklichkeit, seit der Antike, nur wenig über Mykonos bekannt. Durch Ausgrabungen in der antiken Gegend von Ftelia wissen wir, dass die ersten Bewohner der Insel die Karer waren, dann die Phönizier, die Ägypter, die Minoer und die Ionier. Das antike Mykonos entwickelte eine großartige Kultur und tatsächlich wurde dort die älteste Amphore der Antike entdeckt, die auch als Pithos von Mykonos bekannt ist. 1207 kam Mykonos unter die Herrschaft der Venezianer. Die Ghisi-Dynastie übernahm die Kontrolle über die Insel und erbaute zu ihrem Schutz eine Burg. Ein Jahrhundert später gab Giorgio Ghisi, der letzte venezianische Herrscher, die Insel Mykonos an Venedig ab. 1537 kam Mykonos unter die Herrschaft der Türken. Da die Inselbewohner großartige Seefahrer waren, leisteten sie bedeutsame Hilfe im Unabhängigkeitskrieg und steuerten 22 Schiffe, 500 Besatzungsmitglieder und 140 Kanonen zur griechischen Revolution bei. Die heldenhafte revolutionäre Persönlichkeit von Mykonos, Manto Mavrogenous, finanzierte die Revolution, half bei der Organisation von Kämpfen, war Mitglied im Geheimbund „Filiki Etaireia“ und schaffte es, 1822, Truppen für den Aufstand gegen die Türken zu organisieren. Nach der griechischen Unabhängigkeit wurde die Wirtschaft der Insel vollständig zerstört. Später gelang es Mykonos, seine Handelskraft durch die Textilindustrie zu stärken. Tatsächlich waren die Textilien von Mykonos von so hoher Qualität, dass sie in ganz Griechenland und im Ausland gehandelt wurden. Der Tourismus in Mykonos begann in den frühen 1960er Jahren zu blühen, als es zu einem beliebten Rückzugsort für Künstler und später für Hippies wurde. Die archäologische Stätte von Delos wurde zu einer Hauptattraktion und heutzutage ist Mykonos zu einem der beliebtesten Reiseziele der Welt geworden.